長崎市の薬剤師求人・転職｜年収相場と働きやすい職場を4エリアで比べる

長崎の薬剤師年収はいくらか — ハローワーク実測と公的推計で給与を確認

給与の目安となる実測と推計に、全国・県の年収も添えて確認します。
まず全国平均566.8万円(job tag・令和7年賃金構造基本統計調査)は、全国の薬剤師の年収の目安です。
長崎県全体の年収は約560.0万円で、厚生労働省「令和6年賃金構造基本統計調査」の都道府県別の値から、月給×12＋賞与で計算しています。全国値とは調査年が違うため、単純な高低比較は控えます。
ただし県値は長崎市だけでなく佐世保市・諫早市・大村市や五島列島・壱岐・対馬の離島医療圏を含む集計で、長崎市単独の水準とは分けて扱います。

長崎市のハローワーク実測は月給35.0万〜45.7万円（手当込み・賞与なし、正社員38件・25事業所、2026年10月8日検索）で、下限・上限それぞれの事業所ごとの中央値です。
12か月分では約420万〜549万円となり、賞与を含まない目安です。公的推計は、厚労省「令和9年度の一般賃金」（職業安定業務統計による薬剤師の賃金・2026年8月28日公表）の全国値に、長崎ハローワークの地域指数90.3（全国=100）を掛けた時給換算で、経験0年1,663円・3年2,163円・10年2,325円です。
推計には基本給・賞与・手当が含まれます。地域指数は全職業の賃金の地域差を表すため、薬剤師だけの地域差とは分けて扱います。月給の実測とは含まれる項目が違うため、額の高低を直接比べず、求人票の賞与・手当を確かめてください。

ハローワークの求人（2026年10月8日検索）では、長崎市で働く薬剤師の正社員求人が38件（25事業所）。月給は事業所ごとの中央値で下限35.0万円〜上限45.7万円（手当込み・賞与なし）。12か月分にすると約420万〜549万円で、賞与を含まない目安です。パートの求人は20件（10事業所）で、時給は事業所ごとの中央値で2,500〜2,760円。

出典: ハローワークインターネットサービス 求人情報検索（2026年10月8日検索・「薬剤師」と市名で検索し、就業場所が長崎市の薬剤師の求人を編集部が集計）

推計：厚生労働省「令和9年度の一般賃金」（職業安定業務統計による薬剤師の賃金・2026年8月28日公表）の薬剤師の全国の値に、長崎ハローワークの地域指数90.3（全国=100）を掛けると、時給換算で経験0年1,663円・3年2,163円・10年2,325円（基本給・賞与・手当を含む）。地域指数は全職業の賃金の地域差で、薬剤師だけの差ではありません。

出典: 厚生労働省「令和9年度の一般賃金」（職業安定業務統計による薬剤師の賃金・2026年8月28日公表）・同「ハローワーク別地域指数」をもとに編集部が計算（推計）

長崎市固有の採用条件を考えるとき、県全体の約560.0万円（令和6年賃金構造基本統計調査から月給×12＋賞与で計算）は補助の目安にとどめます。
県庁所在地・大学病院立地・全国大手マツキヨ19店やサンドラッグ8店といった競合が集積している長崎市では、実際に応募する職場ごとの条件を確認します。
ハローワーク実測の月給35.0万〜45.7万円（手当込み・賞与なし、下限・上限の事業所ごとの中央値、正社員38件・25事業所）と、公的推計の時給換算1,663〜2,325円（経験0年〜10年、厚労省の一般賃金×ハローワークの地域指数）を参考にします。
現実的には「求人票の下限〜上限と賞与・手当を確かめ、経験・役職・門前医院の科目に応じて着地点を交渉する」という姿勢で条件を比較します。ファルマスタッフの長崎県ページで公開求人の分布を眺めてから、担当者と相場観を擦り合わせるのが手堅い進め方です。

都道府県別第3表 都道府県、職種（特掲）、性別きまって支給する現金給与額、所定内給与額及び年間賞与その他特別給与額（産業計）。長崎県・薬剤師・男女計: きまって支給する現金給与額 390.3千円／年間賞与その他特別給与額 916.3千円／労働者数 79（十人）。

出典:e-Stat 賃金構造基本統計調査 令和6年 一般労働者 都道府県別第3表（厚生労働省・2026-09-27 取得）

どのエリアで働くか — 長崎4エリアの職場マップ(浜町中心街+浦上-葉山+南部戸町+東長崎)

エリアA 浜町・銅座町・万屋町(中心繁華街)は84店、市全体の56.0%を占める最大集積。
思案橋・浜町アーケードから銅座川沿いへと坂道の下に広がる中心繁華街で、個店57店/チェーン27店の内訳は市全体(34.0%)よりさらに個店寄りです。
口コミ数（真ん中の店）3・平均6.4件と来局レビュー件数が4エリアで最も薄く、これは大病院の門前ではなく、小さな医院に紐づく地域密着の個店が厚く集積していることの反映です。
夜間営業20.2%・日曜23.8%は市全体並みで、”中心街に集まっているのに低圧”というのが長崎A圏の顔と言えます。

エリアC 浜口町・葉山(浦上-爆心地北・葉山住宅圏)は52店、A圏に次ぐ二番手。
浦上-爆心地-葉山住宅圏を含み、長崎大学医学部・附属病院や県立長崎病院の周辺に、個店34店/チェーン18店の混在集積が広がります。
口コミ数（真ん中の店）5・平均11.6件と、A圏より病院処方の来局回転が読み取れる中規模市場。
エリアCで最大レビュー数を集めた1店の82件は、大学病院・県病院系の門前調剤薬局の一部で来局が集中していることを示唆しますが、これも1店の特徴で、エリア全体の傾向として過度に読むべきではありません。

エリアB 大浜町・上戸町・戸町(南部・鍋冠山圏)は9店で店数注意。
個店5/チェーン4と拮抗し、夜間営業44.4%・日曜44.4%は4エリアで最も高圧です。
これは南部・戸町のロードサイドに全国大手ドラッグストアが少数ながら集中している構造の反映で、9店という少ないサンプルの中に高開店率のチェーンが占める比率が高いために平均が押し上げられます。
単純に「南部は高圧」と一般化する前に、志望店舗の名前を面接前に個別に確認してください。

エリアD 矢上町・戸石町・東町(東長崎・旧東長崎町域)は5店で店数極小・解釈は特に慎重に。
日見峠を越えた市東部・旧東長崎町合併域の郊外集積です。
個店3/チェーン2の混在で、平均20.0件の来局レビューはmax 54件を含む1店の特徴に押し上げられている可能性が高く、平均値からエリアの性格を読むには適しません。
東長崎で職場を選ぶ場合は、店舗ごとの実データを個別に確かめる姿勢が前提になります。

長崎県の薬剤師求人・薬剤師数の統計値は同社ページ掲載値・直近値を確認。長崎市単独の統計は同社サイトでは市区ページ経由で参照可能。

出典: 薬キャリ / 長崎県の薬剤師求人(2026-07-20 取得)

長崎で求人を探す前に — 市場の基礎数字3つ(公的統計×調べた150店)

土台の数字から確認します。全国の薬剤師有効求人倍率は3.57(令和6年度・job tag)で、資格職としての売り手市場は長崎市でも変わりません。ただし長崎市の求人には、この街ならではの前提があります。調べた150店のうち調剤薬局が116店(77.3%)、個店・地域薬局が99店(66.0%)——編集部が調査した中核市サンプルの中で最も個店比率が高く、坂の街の医院前・地域密着の調剤薬局が街の面を押さえる構造です。ドラッグストア主体の物販型チェーンが街を面で押さえる名古屋・関西型とも、東北勢力の集積が厚い仙台型とも違い、長崎は”個店の海”に全国大手が点在する市場と言えます。

薬剤師の求人市場は全国的に、有効求人倍率3.57倍という全職業平均を大きく上回る水準で推移しています。長崎市でも「求人が見つからない」ことはまず起きません。問題はその先です。求人票には「個店か、チェーンか」「門前の医院は何科か」「夜間・日曜のシフトがどの程度あるか」といった、働きやすさを左右する情報の大半が書かれていません。とりわけ長崎は、坂の街と浦上-爆心地-葉山住宅の医療圏に地場の個店99店が密集し、その足元にマツキヨ・ココカラ19店やサンドラッグ8店の物販型全国大手、そして日本調剤6店・アイン4店の調剤主体全国大手が交差するという、個店主導の中規模市場です。応募の前に、その全体像を地図として持っておく価値があります。

賃金(年収) 全国566.8万円 — 令和7年賃金構造基本統計調査。労働時間157時間 — 令和6年賃金構造基本統計調査の結果を加工して作成。有効求人倍率3.57(令和6年度)・就業者数243,650人。

出典: 職業情報提供サイトjob tag(厚生労働省)/ 薬剤師（労働時間・有効求人倍率・就業者数は2026-07-20取得）

長崎県内における長崎市の位置づけも押さえておきます。県庁所在地であり、県内医療圏の中心として、長崎市は県の薬剤師求人の相当割合を担っています。県全体の年収は、厚生労働省「令和6年賃金構造基本統計調査」の都道府県別の値から月給×12＋賞与で計算すると約560.0万円です。これは県全体の集計で県北の佐世保市や五島列島の離島医療圏を含む数字なので、長崎市単独の水準とは分けて扱います。本記事が調べた150店の分布は、長崎市内の求人の主戦場の地図として使えます。市全体の人口約40.4万人(令和2年国勢調査)を150で割ると、市全体で1店あたり約2,690人。中核市サンプルの中では中位の商圏規模です。

「長崎 薬剤師 求人」と検索した人が最初に知るべき一枚の数字

検索結果に並ぶ求人データベースの一覧は、掲載件数こそ豊富ですが、長崎市の市場の形は教えてくれません。編集部の実収集で最初に浮かび上がったのは、調剤薬局116店(77.3%)・ドラッグストア34店(22.7%)という業態バランスと、その中でチェーン系51店(34.0%)・個店・地域薬局99店(66.0%)というほぼ2対1の個店優位構造でした。

京都は個店67.3%で坂道の街並みに個店が層厚く重なる、名古屋ではスギ薬局131店を筆頭にチェーンが街を押さえる、という具合に都市ごとの主役は違います。長崎は”個店99店の密集に、マツキヨ19店と日本調剤6店が浮かぶ”という独特の構造です。マツキヨ・ココカラ19店を筆頭とした全国大手ドラッグストア(サンドラッグ8・アイン4・ツルハ2・コクミン1)と、九州勢のドラッグストアモリ5店・ドラッグイレブン3店が点在し、その足元に坂の街の個店99店が密集する——長崎で職場を選ぶことは、この個店の海のどこに入るか、あるいは全国大手の物販型/調剤型のどのパターンに入るかを選ぶことに近くなります。

チェーンと個店、どちらで働くか — 個店99の海(66.0%)+マツキヨ19+日本調剤6の勢力図

個店・地域薬局が99店で最大集積。
調剤93/ドラッグ6の内訳で、夜間営業3.0%・日曜4.0%と、市の中で最も日勤寄りです。
口コミ数（真ん中の店）は2件と薄めですが、これは大病院ではなく地域の小さな医院に紐づく地域密着型の店舗が多いという構造の反映で、来局が薄いから経営が弱いという意味ではありません。
個店の平均★3.85は市全体3.78を上回り、坂の街の個店文化の一つの表れといえます。

マツキヨ・ココカラ19店は市の最大集積チェーンで、九州の主要都市らしいマツキヨの厚さを持ちます。
調剤9/ドラッグ10の内訳で夜間営業78.9%・日曜84.2%と物販型ピーク集中の代表。
中央値レビュー13件・平均★3.51は市の物販型ドラッグストアの典型的な水準です。
サンドラッグ8店は調剤1/ドラッグ7で87.5%/87.5%の高開店率、中央値21件と来局はより厚めで、南部・戸町エリアや浜口町のロードサイド沿いに配置される全国型の物販拠点です。

調剤日勤型の主役は日本調剤6店。
全店調剤専門・夜間0%/日曜0%の完全日勤で、平均★4.4は市の主要チェーンの中で最も高く、大学病院や中規模病院の門前を担う全国型調剤の存在感を示します。
アイン4店(調剤3/ドラッグ1・夜間25%・日曜25%・平均★3.6)は北海道発の全国大手として少数ながら長崎にも展開し、日本調剤とは異なる異動範囲の広さが特徴。
単独店のそうごう薬局1店(平均★4.6)・さくら薬局1店(★2.3)・クオール1店(★3.0)・コクミンドラッグ1店(★2.6)は、いずれも対象の店数が1のため、平均★の高低は個別店舗の特徴として理解するべき数字で、チェーン全体の評価とは切り離してください。

九州勢ではドラッグストアモリ5店(調剤0/ドラッグ5・夜間0%/日曜100%・中央値52・★3.62)が日曜の物販需要を担い、ドラッグイレブン3店(調剤0/ドラッグ3・夜間100%/日曜100%・中央値10・★3.7)は少数ながら夜間・日曜フルの物販ピーク型。ツルハ2店も同じく100%/100%の物販型です。
鹿児島がドラッグイレブン15+コスモス14の九州勢並立で個店97を加える三層構造、大分がコスモス23+セイムス17+個店91の三層なら、長崎は“個店99の海(66.0%)+マツキヨ19+日本調剤6”という異なる主役配置——九州本社発チェーンが薄く、全国大手マツキヨ・サンドラ・日本調剤が九州勢モリ・イレブンと交差し、そこに坂の街の個店99店が密集する西九州の中核市場です。

職場タイプ別の選び方(長崎)— “個店の海”の中でどう読むか

選び方の要点は、「個店99店の密集エリアに埋もれないよう、志望店舗の具体名を先に決めてから求人票を探す」ことです。
長崎は個店比率66.0%の街で、求人サイトに載る個店は氷山の一角、Googleマップに載る個店99店の多くは求人サイトに公開されていない可能性があります。
エージェント経由で「志望エリアの個店で非公開求人はあるか」を担当者に聞くと、公開情報の外側にある選択肢が見つかります。

令和5年度末現在の薬局数は 62,828 施設で、前年度に比べ453施設(0.7%)増加している。人口10万対の薬局数は全国50.5。長崎県の薬局総数は同資料表5で確認できる(本記事で調べた150店より大きい)。

出典: 厚生労働省 / 令和5年度衛生行政報告例の概況(PDF)(2026-07-20 取得)

求人票に載らない働きやすさを見抜く — レビュー299件から読む手がかり(候補34件)

18店・本文つきレビュー299件のうち、対人ストレスの気配を含む「攻撃的トーン」14件・「待ち時間」7件・「体制変化」1件——一方で「運営ポジティブ」4件が「運営課題」2件を上回った。

出典: Googleマップ / 長崎市の実店舗レビュー(編集部分類・2026-07-20)。レビュー原文の転載は行わず、多重タグ・保守分類での件数集計のみ

求人の探し方3ルート比較 — 個店主導の長崎はハローワーク+エージェント併用が効く

3ルートのうち、長崎で最も重要なのはハローワークとエージェントの併用です。
個店99店の密集は求人サイトの外側にあり、地場の医院前の小さな調剤薬局は、ハローワークの求人票にしか掲載されないパターンも珍しくありません。
エージェント経由で「非公開求人」として同じ個店にアクセスできる場合もあれば、まったく別ルートで出てくる場合もあります。
両方を回して情報を突き合わせるのが、個店主導の中規模市場である長崎では特に効いてきます。

職業紹介・労働者派遣事業者の許可番号照会は厚生労働省の人材サービス総合サイトで一元的に確認可能。エージェントを選ぶ際は「有料職業紹介事業許可番号」を必ずチェックする。

出典: 人材サービス総合サイト(厚生労働省)(2026-07-20 取得)

正社員で転職する場合 — 長崎市で転職を進める順番

長崎市で調べた150店のうち、個店・地域薬局は99店で、チェーン系（51店・34.0%）より多い地域です。個店の正社員求人は、紹介手数料のかかる転職支援サービスには出ず、ハローワークや店の紹介で決まることがあります。年収を上げたいなら、チェーンの求人と個店の求人を同じ条件表で並べて比べるのが近道です。個店は給与の決め方が店ごとに違うので、賞与の実績と昇給の有無を必ず聞いてください。

夜間も営業している店は21.3%、日曜に開いている店は26.0%で、日勤・日曜休みの職場を選びやすい地域です。夜の手当が付かない分、年収は基本給と賞与の実額で比べてください。月給が同じでも、賞与の月数で年収は大きく変わります。

1. 今の差を測る：この記事の年収のものさしと、自分の源泉徴収票を並べる
2. 転職支援サービスに登録して希望を伝える：勤務地・年収・夜と日曜の可否を同じ言葉で伝える。担当者ガチャを避けるため、最低3社を併用する
3. 求人を集めて同じ表に並べる：基本給・賞与の実績・手当・休日を横に並べる
4. 内情を確かめる：見学で薬剤師の人数・処方箋の枚数・残業の実態を聞く（働きやすさの見抜き方）
5. 条件をすり合わせてから決める：内定後の条件交渉は担当者に任せ、書面で確認する

エージェントを使うなら — 最低3社併用の設計図(長崎)

転職判断のチェックリスト — 5ステップで整理する

1. STEP 1

   移りたい理由を1行にする

   忙しさ・人間関係・年収・シフトのどれが主因かを特定。理由の型は辞めたい理由ランキングで自分の位置を確かめられる

2. STEP 2

   4エリアとチェーン構造で「動けば解決するか」を確認

   シフト負荷が主因なら、個店・地域薬局99店(夜間3.0%)や日本調剤6店・アイン4店の全国大手調剤日勤で解消する余地をエリア別マップで確かめる

3. STEP 3

   年収レンジを3本のものさしで掴む

   ハローワーク実測の月給35.0万〜45.7万円（手当込み・賞与なし、下限・上限の事業所ごとの中央値、長崎市の正社員38件・25事業所）と、公的推計の時給換算1,663〜2,325円（経験0年〜10年、厚労省の一般賃金×ハローワークの地域指数）を参考にします。求人票では下限・上限と賞与・手当を確認してください

4. STEP 4

   情報源を3系統に複線化する

   エージェント最低3社+個店・地場を拾うハローワーク+志望店舗のGoogleマップ確認。長崎は個店主導市場ゆえ、単独ルートで完結しない

5. STEP 5

   面接で「手がかりの答え合わせ」をしてから決める

   ピーク時間帯の人員体制・休憩の実態・直近の退職者数・門前医院の科目を質問し、レビューから立てた仮説を検証したうえで意思決定する